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共聚焦显微镜可运用做分子动态之分析！

除了萤光标定样本的静态空间分佈研究之外，
共聚焦显微镜利用其点接点(Point by point)依序构面的成像方式，
可进一步发展光刺激(Photo-manipulation)方面的动态生理实验。
其方法係利用扫描器及Acousto Optical Turnable Filter (AOTF)光切换装置，
明确指定其成像范围与光刺激范围，再经由软体设定的光刺激旷时摄影流程，拍摄光刺激前后之萤光波长、亮度或分佈位置等变化。
可应用的实验类型包括FRAP (Fluorescence recovery after photo-bleaching)、FLIP (Fluorescence loss in photo-bleaching)、iFRAP (inverse FRAP)、FLAP (Fluorescence localization after photo-bleaching)、Photo-activation、Reversible photo-activation等，并可运用做分子动态之分析(Molecular dynamics analysis)。