标题:基因组测序,基因组DNA首先都要通过酶切成片段

信息分类:站内新闻   作者:yiyi发布   时间:2016-12-18 21:50:47 将本页加入收藏

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正文:

基因组测序,基因组DNA首先都要通过酶切成片段

通过基因组序列可以知道一个完整基因组结构。然而一个基因组有
几百万的碱基序列,因此要解决这一问题就需要应用微生物学,统
计学,生物信息学等多种方法。
    基因组测序有两种方法,基因组DNA首先都要通过酶(限制性内
切酶)或物理方法(如超声波)切成片段。
    方法一:分级归类测序,测序前分级归类,每类都由分类的基
因组片段组成。
    方法二:也叫全基因组鸟枪法,是跳过最初的归类分组实验阶
段,而直接测序任意组的DNA片段,然后通过生物信息学方法,针
对这些DNA片段之间共同的重叠序列,来拼接并重新排出各个已测
序的DNA片段在基因组中的位序。方法一:分级归类测序
    提取DNA后,将其切成片段,一般通过超声波法,切成可操作
的单元(如:用大的载体可以被克隆的片段)50~200 kb,在载体中
将其克隆,如细菌人工染色体(BACs,见图解8);克隆的数量一定
要大,即达到总基因量的5~10倍。这些克隆的基因组片段然后通
过特定探针(分子标记)杂交或限制性内切图谱分析或BAC末端(500
~600 bp)杂交和测序后排序,在这些克隆片段(基因组片段)被排
序后,选取单个克隆再打断成短的,可测序片段,然后由统计学方
法来拼接和排列成基因组序列(比对排列)。











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