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观察水色要注意两个管理要点：

1.色的变化

2.透明度的变化。

在色的颜色变化上是很容易了解，如同前述，不同的色代表不同的藻类甚至可以联想到底质土壤的有机物量、残饵量等。

但是在实务上，“色”是一种主观认定，颜色也很容易被外在背景、光线、藻类浓度所影响。光线、背景这很容易了解，大太阳、阴天、早上、傍晚、逆光、背光，池子旁边的植物….都会影响观察者所观察到的水色。况且不同藻类有不同颜色，但是深浅之间再加上有不同藻类时，就很难加以判断到底是哪一种藻产生所谓的色，是我们要的水色。结果是对同一池水的色泽，每个人的形容词都会不一样，形成鸡同鸭讲的局面。为了避免大家对池水“色”的看法差异。实务上有些老师傅建议，早上清晨去观察水色，是最具代表性，这一点是可以理解与认同的。在清晨时光线稳定，藻类光合作用还没开始旺盛，而这时候水中溶氧偏低，观察水色时顺便看看鱼有没有浮头、贴近水车尾端，虾子有没有靠岸

（虾子缺氧时会靠岸与鱼类浮头现象有很大不同）。

而不同养殖物种时，对水色的诠释也有所不同。在养鱼时，藻色深浅代表水中藻类浓度，当水色太浓时就要换水或是采取其他应变措施。但是在贝类养殖时，藻色的判断就与贝类摄食有关，例如在蚬养殖的时候，矽藻与绿藻混合时水体看起来就有金黄色的感觉（如下图所示）

如果以矽藻为主时，量较少时水色为红棕色，但是量大时却又变成浓咖啡色，这种色就很像涡鞭毛藻的色泽，因此以颜色作为完全的管理指标来说会有所缺憾，而解决的方法最好是用显微镜进行确认一下，是比较好的方式。